塞伯坦星发生内战，威震天领导的狂派发动叛变，而擎天柱领导的博派试图维护和平。最终双方战争的焦点落在了火种源上。这是金刚们的生命之源，它可以产生新的变形金刚生命体。 随着战争进行，塞伯坦星被摧毁，火种源也漂流在宇宙空间，并最终落到了地球。而博派和狂派也在宇宙追逐厮杀中，坠落到了地球……在千万年后，博派与狂派终于被人类唤醒了，由于缺少了生命火种，他们各自依靠地球资源建立起一支没有思想的机器人军团，为了不同的信仰，又开始了新的战争……擎天柱、大黄蜂、铁皮、救护车、大汉、警车、千斤顶、蓝霹雳、威震天、诈骗、红蜘蛛等全数加入了疯狂的战斗！ 而人类，也不可避免地被卷入了这场战争。