公司有一部分发票档案已保存时间超过5年，这些发票应该怎么处理？可以自行销毁吗？
根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，保存期满的发票报经主管税务机关查验后才可以销毁，纳税人不能擅自处理。
法规参考：《中华人民共和国发票管理办法》(国函〔1993〕174号)第四章 发票的开具和保管
第二十九条 开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。
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